基因挖掘 — 从蛋白组发现酶

为你的目标功能从蛋白组中挖掘酶。

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工作原理

五阶段漏斗把整个蛋白组收敛到少数几个可信、已完成对接的酶候选——每一阶段都在本记录中标注。

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    糖酶家族注释

    识别每条序列所属的碳水化合物活性酶家族。

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    同源酶筛选

    与已知目标酶比对,锁定同源候选。

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    信号肽预测 + 序列去冗余

    标记分泌型酶,并去除近重复序列。

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    结构精修 + 分子对接

    预测结合口袋并给底物结合打分。

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    结构预测复核 + 交叉验证

    交叉核验最高置信候选的结构与打分——包括你自己的 AlphaFold3 模型。

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功能

蛋白组规模的酶挖掘

扫描整个蛋白组 FASTA,为单一目标催化功能浮现候选酶。

糖酶家族注释

在下游筛选之前,将序列归类到碳水化合物活性酶家族。

信号肽与结构预测

标记分泌型候选,然后为幸存者预测高置信结构(ipTM / pLDDT)。

分子对接与交叉验证

在预测口袋中给底物结合打分,再用第二个打分函数交叉核验。

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输入

提供一个蛋白组,可选参考酶和底物——然后运行漏斗。

直接粘贴,或上传文件——它只在本地读入此框,永不离开你的浏览器。

演示——在本页使用示例数据运行。
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流程进度

每个阶段都在收窄候选池。运行漏斗,逐阶段观察它推进。

输入蛋白组— 序列
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    结果

    示例数据

    前 20 个候选,下方可排序筛选。展开卡片查看结构、序列与对接详情。

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    工作空间

    把候选保存到你的工作空间

    每个保存的候选都成为一个可复现的记录,带一个可在方法中引用的 Entry ID。移交到密码子优化和表达盒设计时会预填所选序列。

    工作空间集成将在后续任务中到来——本页当前是带示例数据的前端预览。