EN| 中文| Русский
— Запись 001 · 2026.09.15 —

Проектируйте свой проект по синтетической биологии от начала до конца

Соедините оптимизацию кодонов, дизайн праймеров, инженерию метаболических путей и поиск ферментов в один воспроизводимый рабочий процесс — от последовательности до штамма.

Начать Смотреть инструменты
01

Рабочие процессы

Каждый рабочий процесс объединяет инструменты для реальной исследовательской задачи — результаты переходят от шага к шагу и полностью воспроизводимы.

Конструирование векторов
От кодирующей последовательности до собранной плазмиды.
Оптимизация кодонов→Дизайн праймеров→Сборка
Дизайн путей
Сбалансируйте метаболический путь к целевому продукту.
Дизайн пути→Анализ потоков→Инженерия штамма
Поиск ферментов
Найдите и проверьте каталитического кандидата — от генома до докинга.
Поиск генов→Гомологичное моделирование→Молекулярный докинг
Литература и данные
Найдите, проверьте и организуйте доказательную базу вашего дизайна.
Поиск литературы→Перекрёстная проверка→Цитирование
02

Основные инструменты

Ключевые инструменты для проекта по синтетической биологии — каждый со своей полной страницей.

01Дизайн метаболических путей
Спроектируйте и сбалансируйте метаболический путь от субстрата к продукту.
На основе курируемой библиотеки путей инструмент собирает биосинтетический маршрут для вашего соединения и проверяет каждый шаг на баланс потоков — выявляя узкие места до начала сборки.
Курируемая библиотека биосинтетических путей Проверка баланса потоков выявляет узкие места Рекомендации по настройке штамма Проверено на эталонных путях
путьбаланс потоковштаммузкое место
Открыть инструмент →
02Дизайн CRISPR
Спроектируйте sgRNA и плечи гомологии для точного редактирования генома.
Оцените активность направляющих РНК и проверьте их на нецелевые участки против генома вашего штамма. Плечи гомологии и полная кассета редактирования — в одном дизайне.
Дизайн sgRNA с оценкой целевой активности Скрининг нецелевых участков по 30 геномам штаммов Дизайн плечей гомологии для HDR Полная кассета редактирования на выходе
sgRNAплечо гомологиинецелевой30 штаммов
Открыть инструмент →
03Поиск генов
Найдите каталитические кандидаты — от генома до подтверждения.
Воронка от последовательности до попадания: скрининг семейств CAZy, гомологичный поиск BLAST и предсказание сигнальных пептидов выявляют кандидатов; молекулярный докинг их подтверждает.
Скрининг семейств CAZy Гомологичный поиск BLAST Предсказание сигнальных пептидов Проверка молекулярным докингом
CAZyBLASTсигнальный пептиддокинг
Открыть инструмент →
04Мультигенная сборка
Соберите несколько единиц транскрипции в один вектор.
Расположите ваши кассеты и проверьте каждое соединение и рамку считывания от начала до конца — чтобы заказанный вектор был именно тем, что вы задумали.
Расположение единиц транскрипции Проверка соединений Проверка рамки считывания Вектор, готовый к заказу
единица транскрипциисоединениекассетавектор
Открыть инструмент →
05Дизайнер экспрессионных кассет
Спроектируйте кассеты промотор–ген–терминатор.
Соберите полные единицы экспрессии из проверенных элементов и экспортируйте аннотированный GenBank, готовый к клонированию.
Расположение промотор–терминатор Библиотека проверенных элементов Экспорт аннотированного GenBank Вывод, готовый к клонированию
промотортерминаторGenBankклонирование
Открыть инструмент →
06Обзор исследовательской области
Охватите исследовательскую область с одного взгляда.
Литература, методы и ключевые достижения, сжатые в быстрый и читаемый обзор — поймите новую область за минуты, с цитируемыми и проверяемыми источниками.
Обзор литературы области Сжатие методов и ключевых достижений Читаемый обзор за минуты Цитируемые, проверяемые источники
с одного взглядалитератураметодысжато
Открыть инструмент →
03

Создайте воспроизводимый пайплайн

Каждый запуск фиксирует входные данные, параметры и результаты — поэтому результат можно воспроизвести, экспортировать и процитировать.

От последовательности до штамма — в одной цепочке

Начните с целевой кодирующей последовательности. Оптимизируйте кодоны для вашего хозяина, разработайте праймеры, соберите вектор и проследите каждый шаг до исходных данных. Каждый результат несёт идентификатор воспроизводимости для раздела методов.

Попробовать пайплайн
04

Документация

Начало работы

Настройте первый рабочий процесс и разберитесь в воспроизводимости.

Справочник инструментов

Параметры, значения по умолчанию и версии баз данных.

О проекте

Методы, источники данных и как проверяются результаты.