端到端设计你的合成生物学项目

将密码子优化、引物设计、通路工程与酶挖掘串联成一条可复现的工作流——从序列到菌株。

01

工作流

每条工作流把完成一项真实研究任务所需的工具串起来,结果从一步流到下一步,全程可复现。

02

核心工具

合成生物学项目的基础仪器——每个工具各占一整页版面。

01代谢通路设计
设计并平衡一条从底物到产物的代谢通路。
基于精选通路库,为你的目标化合物拼装生物合成路线,并逐步校验通量平衡——在动手构建之前就标出瓶颈。
常见生物合成路线的精选通路库 通量感知的平衡校验,标记瓶颈 针对底盘菌株的调优建议 对照金标准通路验证
通路通量平衡底盘瓶颈
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02CRISPR 设计
设计 sgRNA 与同源臂,实现精确的基因组编辑。
对向导 RNA 做靶向活性评分,并针对你的菌株自身基因组筛查脱靶位点。同源臂与完整编辑盒一次设计完成。
sgRNA 设计与靶向活性评分 跨 30 株底盘基因组脱靶筛查 面向 HDR 的同源臂设计 输出完整编辑盒
sgRNA同源臂脱靶30 株底盘
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03基因挖掘
从基因组到确认,挖掘催化候选酶。
从序列到命中的漏斗:CAZy 家族筛查、BLAST 同源检索与信号肽预测筛选候选,再由分子对接验证。
CAZy 家族筛查 BLAST 同源检索 信号肽预测 分子对接验证
CAZyBLAST信号肽对接
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04多基因组装
将多个转录单元组装进一个载体。
排布你的表达盒,端到端校验每一处接缝与读码框——让你订购的载体就是你设想的载体。
转录单元排布 接缝校验 读码框检查 输出可订购载体
转录单元接缝表达盒载体
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05表达盒设计器
设计启动子–基因–终止子表达盒。
用已验证的元件构建完整表达单元,导出带注释的 GenBank,可直接用于克隆。
启动子–基因–终止子排布 已验证元件库 带注释的 GenBank 导出 可直接克隆的输出
启动子终止子GenBank克隆
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06研究领域概览
一眼把握一个研究领域。
将文献、方法与关键进展浓缩为快速可读的概览——几分钟了解一个新领域,来源可引用、可验证。
领域文献调研 浓缩方法与关键进展 几分钟即可读的概览 可引用、可验证的来源
一眼概览文献方法浓缩
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03

构建可复现的流程

每一次运行都记录输入、参数与输出——因此结果可复现、可导出、可引用。

从序列到菌株,一条链完成

从目标编码序列开始。为你的宿主优化密码子,设计引物,组装载体,并把每一步回溯到输入。每个结果都带有一个可复现性 ID,可直接粘贴进你的方法学章节。

04

文档