Вставьте белковую последовательность и выберите хозяина, чтобы получить кодон-оптимизированную транскрипционную единицу с маркером селекции — в виде линейной кассеты или полной кольцевой плазмиды.
От белковой последовательности и хозяина к готовой кассете — пять этапов, каждый отмечен в этой записи.
Вставьте аминокислотную последовательность и выберите один из 14 организмов-хозяев.
CDS оптимизируется по кодонам для хозяина и оценивается по CAI, GC и редким кодонам.
Промотор, RBS и терминатор подбираются по хозяину, каждый с указанием источника.
Транскрипционная единица собирается с маркером селекции — линейная или кольцевая.
Скачайте FASTA/GenBank, скопируйте последовательность и сохраните запуск в рабочее пространство.
Бактерии, дрожжи, мицелиальные грибы, клетки млекопитающих, насекомых, растений и бесклеточные системы.
CAI до/после, содержание GC, редкие кодоны и проверки ограничений для выбранного хозяина.
Каждый промотор, RBS и терминатор снабжён литературным источником с флагом проверки.
Кассета с маркером селекции или полная плазмида на основе остова хозяина.
Введите белковую последовательность, выберите хозяина, затем спроектируйте кассету.
Наблюдайте за этапами проектирования.
Собранная кассета с выбором элементов, отчётом по кодонам, картой характеристик, праймерами и отслеживаемыми источниками.
Каждый сохранённый запуск становится воспроизводимой записью с Entry ID, который можно цитировать в методах. Передайте выбранные элементы в мультигенную сборку, чтобы построить более крупную конструкцию.
Сначала запустите проектирование, затем сохраните его здесь.