添加或选择模块、选择组装路线,然后驯化位点、分配接缝,得到带引物与风险提示的完整环状质粒。
从基因模块到完整质粒,五个阶段标注本条目中的每一步。
从宿主、启动子、CDS 与终止子构建模块,或粘贴整段序列。
多选、重排,并设定每个模块的方向。
选择骨架、筛选标记与组装路线(自动、体外或体内)。
自动扫描并清除 Type IIS 位点(BsaI/BsmBI/BbsI)。
分配接缝、组装环状质粒并设计引物。
体外 Golden Gate、层级 MoClo、Gibson 与体内重组;按模块数与宿主自动选择。
扫描并清除 Type IIS 位点(BsaI/BsmBI/BbsI),使其不阻断组装。
在模块间分配接缝,并生成菌落 PCR 与测序引物。
下单前标记 GC 窗口、重复与茎环结构。
在下方添加模块,然后选择、排序并组装。
分阶段观察组装进展。
组装后的质粒,附路线、接缝、驯化报告、菌落 PCR 引物与风险列表。
每次保存的运行都会成为可复现条目,带可在方法学中引用的 Entry ID。本工具保存组装好的质粒 —— 无下游交接。
先运行组装,再在此保存。